摘要:
目的:采用生物信息方法预测和鉴定survivin抗原HLAA2+限制性CTL表位,为探索基于survivin的肿瘤免疫治疗奠定基础。〖HT5W〗方法:〖HT5"SS〗采用超基序法和量化基序法对靶抗原survivin HLAA2+限制性 CTL表位进行预测;选取得分>10的表位肽为候选对象,并进行人工合成。采用T2细胞,以HLAA2结合实验和流式细胞术(FITC染色)检测候选CTL表位肽的结合亲和力\[以荧光系数(fluorescence index,FI)表示\];以HLAA2解离实验和流式细胞术检测其结合稳定性\[以复合物解离50%的时间DC50(dissociation complex 50%)表示\]。〖HT5W〗结果:〖HT5"SS〗预测到的候选survivin CTL表位肽分别是:20STFKNWPFL28 (SV2028)、23KNWPFLEGC31 (SV2331)、96LTLGEFLKL104 (SV96104)、6LPPAWQPFL14 (SV614)、33CTPERMAEA41 (SV3341)、46CPTENEPDL54 (SV4654)、130KVRRAIEQL138 (SV130138)、37RMAEAGFIH45 (SV3745)、88SVKKQFEEL96 (SV8896)。亲和力分析显示: SV2028 、SV96104、SV130138、SV2331的FI分别为8.61、6.88、5.89、3.81;SV3341、SV614、 SV4654、 SV3745 、SV8896的FI分别为0.31、-0.29、-04、-0.16和-0.03;稳定性分析结果DC50为:SV2028、SV96104、SV130138 >8 h;SV2331 为4~6 h;SV614、SV3341、SV8896为2~4 h;SV4654、 SV3745为0~2 h。结果提示,SV2028 、 SV96104、SV130138为高亲和力表位肽,SV2331为中等亲和力表位肽,SV3341、SV614、 SV4654、 SV3745 、SV8896为低亲和力表位肽。〖HT5W〗结论:〖HT5"SS〗超基序法、量化基序法可快速有效地预测抗原表位,SV2028 、SV96104、SV130138有可能是survivin HLAA2+ CTL表位,可用于后续研究。